Leczenie endodontyczne (kanałowe) polega na usunięciu z wnętrza korony i korzeni zęba miazgi (potocznie "nerwów"). Jest to konieczne w przypadku zaawansowanej próchnicy, złamania korony zęba oraz innych sytuacji, kiedy niemożliwe jest pozostawienie zęba żywego. W większości przypadków nie stosujemy dewitalizacji ("trucia") zęba, ponieważ jak się obecnie uważa jest to metoda przestarzała, która może powodować nieodwracalne uszkodzenia w kości wokół wierzchołka korzenia. Jeżeli leczony endodontycznie ząb jest żywy, dla zapewnienia komfortu i bezbolesności zabieg wykonywany jest w znieczuleniu miejscowym.
Aby pozbawiony miazgi ząb mógł służyć pacjentowi przez wiele lat niezbędne jest prawidłowe oczyszczenie, poszerzenie oraz wypełnienie kanałów korzeniowych. Zapobiega to rozwojowi bakterii wewnątrz zęba i tworzeniu się zmian chorobowych w kości wokół korzeni. Do oczyszczenia i przygotowania kanałów korzeniowych stosuje się bardzo cienkie pilniki wykonane ze stali lub stopu niklu z tytanem. Wykorzystujemy również maszynowe pilniki systemu NiTi TEE®. Szczelne zamknięcie kanałów zapewnia żywica nazywaną gutaperką oraz pasty uszczelniające. Bardzo pomocne w wykonaniu i kontroli zabiegu są radiowizjografia oraz endometr.